MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2

Total Repeats: 6298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009927	GTGAT	2	10	58026	58035	20 %	40 %	40 %	0 %	158339957
1002	NC_009927	TAC	2	6	58061	58066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339957
1003	NC_009927	GAA	3	9	58103	58111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339957
1004	NC_009927	GAT	2	6	58162	58167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339957
1005	NC_009927	AAG	2	6	58245	58250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339957
1006	NC_009927	GCA	2	6	58251	58256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339957
1007	NC_009927	TGG	2	6	58325	58330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339957
1008	NC_009927	GAT	2	6	58402	58407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339957
1009	NC_009927	CAA	2	6	58408	58413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339957
1010	NC_009927	AAG	2	6	58418	58423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339957
1011	NC_009927	TCAA	2	8	58437	58444	50 %	25 %	0 %	25 %	158339957
1012	NC_009927	ATT	2	6	58525	58530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339957
1013	NC_009927	ATC	2	6	58540	58545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339957
1014	NC_009927	TC	3	6	58580	58585	0 %	50 %	0 %	50 %	158339957
1015	NC_009927	TCAG	2	8	58698	58705	25 %	25 %	25 %	25 %	158339957
1016	NC_009927	GGA	2	6	58717	58722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339957
1017	NC_009927	GATTG	2	10	58759	58768	20 %	40 %	40 %	0 %	158339957
1018	NC_009927	GAA	2	6	58807	58812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339957
1019	NC_009927	AG	3	6	58816	58821	50 %	0 %	50 %	0 %	158339957
1020	NC_009927	GA	3	6	58900	58905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009927	ACA	2	6	59055	59060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_009927	AAG	2	6	59086	59091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009927	T	7	7	59282	59288	0 %	100 %	0 %	0 %	158339958
1024	NC_009927	CCTG	2	8	59305	59312	0 %	25 %	25 %	50 %	158339958
1025	NC_009927	GAT	2	6	59387	59392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339959
1026	NC_009927	AAG	2	6	59469	59474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339959
1027	NC_009927	TCA	2	6	59481	59486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339959
1028	NC_009927	AGT	2	6	59524	59529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339959
1029	NC_009927	CTTT	2	8	59549	59556	0 %	75 %	0 %	25 %	158339959
1030	NC_009927	TCT	2	6	59583	59588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339959
1031	NC_009927	CCA	2	6	59664	59669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339959
1032	NC_009927	GAA	2	6	59985	59990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009927	T	6	6	60029	60034	0 %	100 %	0 %	0 %	158339960
1034	NC_009927	CCG	2	6	60140	60145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158339960
1035	NC_009927	GTC	2	6	60167	60172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339960
1036	NC_009927	AAT	2	6	60262	60267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339960
1037	NC_009927	TCT	2	6	60284	60289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339960
1038	NC_009927	A	6	6	60328	60333	100 %	0 %	0 %	0 %	158339960
1039	NC_009927	ATT	2	6	60414	60419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009927	TA	5	10	60422	60431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009927	TTAA	2	8	60434	60441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009927	GA	3	6	60548	60553	50 %	0 %	50 %	0 %	158339961
1043	NC_009927	TGA	2	6	60602	60607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339961
1044	NC_009927	GAT	2	6	60617	60622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339961
1045	NC_009927	ACTG	2	8	60690	60697	25 %	25 %	25 %	25 %	158339961
1046	NC_009927	CTC	2	6	60703	60708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158339961
1047	NC_009927	ATC	2	6	60709	60714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339961
1048	NC_009927	AGG	2	6	60751	60756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339961
1049	NC_009927	CT	3	6	60768	60773	0 %	50 %	0 %	50 %	158339961
1050	NC_009927	GAA	2	6	60848	60853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339961
1051	NC_009927	GAC	2	6	60888	60893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339961
1052	NC_009927	TCA	2	6	60903	60908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339961
1053	NC_009927	AGTA	2	8	60909	60916	50 %	25 %	25 %	0 %	158339961
1054	NC_009927	AT	3	6	60930	60935	50 %	50 %	0 %	0 %	158339961
1055	NC_009927	TTC	2	6	61081	61086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339961
1056	NC_009927	ACTG	2	8	61165	61172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_009927	ACT	2	6	61197	61202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_009927	AAC	2	6	61369	61374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_009927	A	6	6	61397	61402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009927	AAT	2	6	61406	61411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009927	TGACA	2	10	61435	61444	40 %	20 %	20 %	20 %	158339962
1062	NC_009927	TGC	2	6	61483	61488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339962
1063	NC_009927	TCA	2	6	61522	61527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339962
1064	NC_009927	AGC	2	6	61558	61563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339962
1065	NC_009927	ACCC	2	8	61629	61636	25 %	0 %	0 %	75 %	158339963
1066	NC_009927	CGA	2	6	61682	61687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339963
1067	NC_009927	ACTGG	2	10	61707	61716	20 %	20 %	40 %	20 %	158339963
1068	NC_009927	GAG	2	6	61779	61784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339963
1069	NC_009927	GAT	2	6	61816	61821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339963
1070	NC_009927	T	6	6	61854	61859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009927	CCAG	2	8	61891	61898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_009927	TAC	2	6	61950	61955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339964
1073	NC_009927	GAAC	2	8	61986	61993	50 %	0 %	25 %	25 %	158339964
1074	NC_009927	AGA	2	6	61996	62001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339964
1075	NC_009927	AAC	2	6	62036	62041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339964
1076	NC_009927	CA	3	6	62092	62097	50 %	0 %	0 %	50 %	158339964
1077	NC_009927	TTA	2	6	62187	62192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339964
1078	NC_009927	TGC	2	6	62230	62235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339964
1079	NC_009927	CTGA	2	8	62369	62376	25 %	25 %	25 %	25 %	158339964
1080	NC_009927	AGT	2	6	62393	62398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339964
1081	NC_009927	CAG	2	6	62420	62425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339964
1082	NC_009927	ATTT	2	8	62460	62467	25 %	75 %	0 %	0 %	158339964
1083	NC_009927	TGA	2	6	62469	62474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339964
1084	NC_009927	AAC	2	6	62496	62501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339964
1085	NC_009927	TGA	2	6	62506	62511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339964
1086	NC_009927	ATG	2	6	62517	62522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339964
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1089	NC_009927	GGAC	2	8	62753	62760	25 %	0 %	50 %	25 %	158339964
1090	NC_009927	ATG	3	9	62772	62780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339964
1091	NC_009927	TATC	2	8	62845	62852	25 %	50 %	0 %	25 %	158339964
1092	NC_009927	AGC	2	6	62877	62882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339964
1093	NC_009927	ATC	2	6	62965	62970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_009927	TGA	2	6	63211	63216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339965
1095	NC_009927	TC	3	6	63259	63264	0 %	50 %	0 %	50 %	158339965
1096	NC_009927	GTCT	2	8	63358	63365	0 %	50 %	25 %	25 %	158339965
1097	NC_009927	CAC	2	6	63408	63413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339965
1098	NC_009927	CAC	2	6	63528	63533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339965
1099	NC_009927	GGCT	2	8	63552	63559	0 %	25 %	50 %	25 %	158339965
1100	NC_009927	ATCC	2	8	63643	63650	25 %	25 %	0 %	50 %	158339965
1101	NC_009927	CATG	2	8	63804	63811	25 %	25 %	25 %	25 %	158339966
1102	NC_009927	CACAC	2	10	63982	63991	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1103	NC_009927	AGG	2	6	64127	64132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009927	GTT	2	6	64224	64229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009927	TTA	2	6	64240	64245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009927	CCAA	2	8	64309	64316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_009927	TGAT	2	8	64393	64400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009927	TCAAC	2	10	64556	64565	40 %	20 %	0 %	40 %	158339967
1109	NC_009927	ATA	2	6	64575	64580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339967
1110	NC_009927	TTA	2	6	64631	64636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339967
1111	NC_009927	CTT	2	6	64834	64839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_009927	AAAT	2	8	64848	64855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009927	TTAA	2	8	64871	64878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009927	CCT	2	6	64967	64972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_009927	AGG	2	6	64989	64994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009927	CAGTC	2	10	64999	65008	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1117	NC_009927	TG	3	6	65032	65037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009927	TTAA	2	8	65116	65123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009927	GA	3	6	65176	65181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009927	CAG	2	6	65208	65213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339968
1121	NC_009927	AGC	2	6	65352	65357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339968
1122	NC_009927	CT	3	6	65404	65409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_009927	G	6	6	65483	65488	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009927	CCCA	2	8	65535	65542	25 %	0 %	0 %	75 %	158339969
1125	NC_009927	GAC	2	6	65588	65593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339969
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1127	NC_009927	GA	3	6	65668	65673	50 %	0 %	50 %	0 %	158339969
1128	NC_009927	CAC	2	6	65677	65682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339969
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